La struttura rappresenta uno dei più importanti punti di riferimento della sanità pugliese per l’Alta specialità. Insieme ad Anthea hospital di Bari (altra struttura del Gruppo Villa Maria) è tra le strutture che esegue il maggior numero di procedure di angioplastica (dati Gise 2005). Città di Lecce è considerato il primo centro di Cardiochirurgia della Puglia avendo all'attivo più di mille interventi l'anno. Nell’ambito della convenzione esistente tra Gruppo Villa Maria e il Dipartimento di Scienze dell’Università degli Studi “G. D’Annunzio” di Chieti, Città di Lecce Hospital offre possibilità di accesso agli studenti per svolgere attività di apprendimento clinico.

Città di Lecce hospital è un importante punto di riferimento anche per l'attività di Radioterapia. Con l'acquisizione di un acceleratore lineare di ultima generazione, la struttura eroga decina di migliaia di trattamento nei confronti di pazienti pugliesi, limitando così gli esodi verso altri centri di riferimento nazionale.